眼科图像可能包含相同的外观病理,这些病理可能导致自动化技术的失败以区分不同的视网膜退行性疾病。此外,依赖大型注释数据集和缺乏知识蒸馏可以限制基于ML的临床支持系统在现实环境中的部署。为了提高知识的鲁棒性和可传递性,需要一个增强的特征学习模块才能从视网膜子空间中提取有意义的空间表示。这样的模块(如果有效使用)可以检测到独特的疾病特征并区分这种视网膜退行性病理的严重程度。在这项工作中,我们提出了一个具有三个学习头的健壮疾病检测结构,i)是视网膜疾病分类的监督编码器,ii)一种无监督的解码器,用于重建疾病特异性的空间信息,iiii iii)一个新的表示模块,用于学习模块了解编码器折叠功能和增强模型的准确性之间的相似性。我们对两个公开可用的OCT数据集的实验结果表明,该模型在准确性,可解释性和鲁棒性方面优于现有的最新模型,用于分布视网膜外疾病检测。
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从心电图中自动化心律失常的自动化检测需要一个可靠且值得信赖的系统,该系统在电动扰动下保持高精度。许多机器学习方法在对心电图的心律不齐分类方面已经达到了人类水平的表现。但是,这些体系结构容易受到对抗攻击的影响,这可能会通过降低模型的准确性来误解ECG信号。对抗性攻击是在原始数据中注入的小型制作的扰动,这些扰动表现出信号的过度分发转移,以错误地分类正确的类。因此,滥用这些扰动的虚假住院和保险欺诈引起了安全问题。为了减轻此问题,我们引入了第一个新型的条件生成对抗网络(GAN),可抵抗对抗性攻击的ECG信号,并保持高精度。我们的体系结构集成了一个新的类加权目标函数,用于对抗扰动识别和新的块,用于辨别和组合学习过程中信号中的分布外变化,以准确地对各种心律失常类型进行分类。此外,我们在六种不同的白色和黑色盒子攻击上对架构进行了基准测试,并将它们与最近提出的其他心律失常分类模型进行比较,这是两个公开可用的ECG心律失常数据集。该实验证实,我们的模型对这种对抗性攻击更为强大,以高精度对心律不齐进行分类。
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光学相干断层扫描(OCT)有助于眼科医生评估黄斑水肿,流体的积累以及微观分辨率的病变。视网膜流体的定量对于OCT引导的治疗管理是必需的,这取决于精确的图像分割步骤。由于对视网膜流体的手动分析是一项耗时,主观和容易出错的任务,因此对快速和健壮的自动解决方案的需求增加了。在这项研究中,提出了一种名为Retifluidnet的新型卷积神经结构,用于多级视网膜流体分割。该模型受益于层次表示使用新的自适应双重注意(SDA)模块的纹理,上下文和边缘特征的学习,多个基于自适应的Skip Connections(SASC)以及一种新颖的多尺度深度自我监督学习(DSL)方案。拟议的SDA模块中的注意机制使该模型能够自动提取不同级别的变形感知表示,并且引入的SASC路径进一步考虑了空间通道相互依存,以串联编码器和解码器单元,从而提高了表示能力。还使用包含加权版本的骰子重叠和基于边缘的连接损失的联合损失函数进行了优化的retifluidnet,其中将多尺度局部损失的几个分层阶段集成到优化过程中。该模型根据三个公开可用数据集进行验证:润饰,Optima和Duke,并与几个基线进行了比较。数据集的实验结果证明了在视网膜OCT分割中提出的模型的有效性,并揭示了建议的方法比现有的最新流体分割算法更有效,以适应各种图像扫描仪器记录的视网膜OCT扫描。
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The lack of efficient segmentation methods and fully-labeled datasets limits the comprehensive assessment of optical coherence tomography angiography (OCTA) microstructures like retinal vessel network (RVN) and foveal avascular zone (FAZ), which are of great value in ophthalmic and systematic diseases evaluation. Here, we introduce an innovative OCTA microstructure segmentation network (OMSN) by combining an encoder-decoder-based architecture with multi-scale skip connections and the split-attention-based residual network ResNeSt, paying specific attention to OCTA microstructural features while facilitating better model convergence and feature representations. The proposed OMSN achieves excellent single/multi-task performances for RVN or/and FAZ segmentation. Especially, the evaluation metrics on multi-task models outperform single-task models on the same dataset. On this basis, a fully annotated retinal OCTA segmentation (FAROS) dataset is constructed semi-automatically, filling the vacancy of a pixel-level fully-labeled OCTA dataset. OMSN multi-task segmentation model retrained with FAROS further certifies its outstanding accuracy for simultaneous RVN and FAZ segmentation.
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2019年12月,一个名为Covid-19的新型病毒导致了迄今为止的巨大因果关系。与新的冠状病毒的战斗在西班牙语流感后令人振奋和恐怖。虽然前线医生和医学研究人员在控制高度典型病毒的传播方面取得了重大进展,但技术也证明了在战斗中的重要性。此外,许多医疗应用中已采用人工智能,以诊断许多疾病,甚至陷入困境的经验丰富的医生。因此,本调查纸探讨了提议的方法,可以提前援助医生和研究人员,廉价的疾病诊断方法。大多数发展中国家难以使用传统方式进行测试,但机器和深度学习可以采用显着的方式。另一方面,对不同类型的医学图像的访问已经激励了研究人员。结果,提出了一种庞大的技术数量。本文首先详细调了人工智能域中传统方法的背景知识。在此之后,我们会收集常用的数据集及其用例日期。此外,我们还显示了采用深入学习的机器学习的研究人员的百分比。因此,我们对这种情况进行了彻底的分析。最后,在研究挑战中,我们详细阐述了Covid-19研究中面临的问题,我们解决了我们的理解,以建立一个明亮健康的环境。
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Diabetic Retinopathy (DR) is a leading cause of vision loss in the world, and early DR detection is necessary to prevent vision loss and support an appropriate treatment. In this work, we leverage interactive machine learning and introduce a joint learning framework, termed DRG-Net, to effectively learn both disease grading and multi-lesion segmentation. Our DRG-Net consists of two modules: (i) DRG-AI-System to classify DR Grading, localize lesion areas, and provide visual explanations; (ii) DRG-Expert-Interaction to receive feedback from user-expert and improve the DRG-AI-System. To deal with sparse data, we utilize transfer learning mechanisms to extract invariant feature representations by using Wasserstein distance and adversarial learning-based entropy minimization. Besides, we propose a novel attention strategy at both low- and high-level features to automatically select the most significant lesion information and provide explainable properties. In terms of human interaction, we further develop DRG-Net as a tool that enables expert users to correct the system's predictions, which may then be used to update the system as a whole. Moreover, thanks to the attention mechanism and loss functions constraint between lesion features and classification features, our approach can be robust given a certain level of noise in the feedback of users. We have benchmarked DRG-Net on the two largest DR datasets, i.e., IDRID and FGADR, and compared it to various state-of-the-art deep learning networks. In addition to outperforming other SOTA approaches, DRG-Net is effectively updated using user feedback, even in a weakly-supervised manner.
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通过研究视网膜生物结构的进展,可以识别眼病的存在和严重性是可行的。眼底检查是检查眼睛的生物结构和异常的诊断程序。诸如青光眼,糖尿病性视网膜病和白内障等眼科疾病是世界各地视觉障碍的主要原因。眼疾病智能识别(ODIR-5K)是研究人员用于多标签的多份多疾病分类的基准结构底面图像数据集。这项工作提出了一个歧视性内核卷积网络(DKCNET),该网络探讨了歧视区域的特征,而无需增加额外的计算成本。 DKCNET由注意力块组成,然后是挤压和激发(SE)块。注意块从主干网络中获取功能,并生成歧视性特征注意图。 SE块采用区分特征图并改善了通道相互依赖性。使用InceptionResnet骨干网络观察到DKCNET的更好性能,用于具有96.08 AUC,94.28 F1-SCORE和0.81 KAPPA得分的ODIR-5K底面图像的多标签分类。所提出的方法根据诊断关键字将通用目标标签拆分为眼对。基于这些标签,进行了过采样和不足采样以解决阶级失衡。为了检查拟议模型对培训数据的偏见,对ODIR数据集进行了训练的模型将在三个公开可用的基准数据集上进行测试。发现它在完全看不见的底面图像上也具有良好的性能。
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每年发出3000万光学相干断层扫描(OCT)成像测试,以诊断各种视网膜疾病,但对OCT扫描的准确诊断需要训练有素的眼科医生,他们仍然容易发出错误。通过更好的诊断系统,可能完全避免了视网膜疾病引起的许多视力丧失情况。在这项工作中,我们开发了一种新的深入学习架构,可用于解释的视网膜疾病的准确分类,这实现了最先进的准确性。此外,我们强调生产模型决策的定性和量化解释。我们的算法产生了指示OCT扫描中的确切区域的热量表,该模型在做出决定时的重点。结合OCT分段模型,这使我们能够产生专注于专家的模型的特定视网膜层的定量分解。我们的工作是第一个以这种方式制作了对模型决策的详细量化解释。我们的准确性和可解释性的组合可以临床应用于更好的患者护理。
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胸部射线照相是一种相对便宜,广泛的医疗程序,可传达用于进行诊断决策的关键信息。胸部X射线几乎总是用于诊断呼吸系统疾病,如肺炎或最近的Covid-19。在本文中,我们提出了一个自我监督的深神经网络,其在未标记的胸部X射线数据集上掠夺。学习的陈述转移到下游任务 - 呼吸系统疾病的分类。在四个公共数据集获得的结果表明,我们的方法在不需要大量标记的培训数据的情况下产生竞争力。
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准确的视网膜血管分割是许多计算机辅助诊断系统的重要任务。然而,由于眼睛的复杂血管结构,它仍然是一个具有挑战性的问题。最近提出了许多血管分割方法,但需要更多的研究来处理薄薄和微小血管的细分。为了解决这个问题,我们提出了一种新的深度学习管道,结合了残留致密净块的效率以及剩余挤压和励磁块。我们在实验上验证了我们在三个数据集中的方法,并表明我们的管道优于最新的现有技术,以评估小血管的捕获度量相关的敏感度量。
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Deep learning (DL) analysis of Chest X-ray (CXR) and Computed tomography (CT) images has garnered a lot of attention in recent times due to the COVID-19 pandemic. Convolutional Neural Networks (CNNs) are well suited for the image analysis tasks when trained on humongous amounts of data. Applications developed for medical image analysis require high sensitivity and precision compared to any other fields. Most of the tools proposed for detection of COVID-19 claims to have high sensitivity and recalls but have failed to generalize and perform when tested on unseen datasets. This encouraged us to develop a CNN model, analyze and understand the performance of it by visualizing the predictions of the model using class activation maps generated using (Gradient-weighted Class Activation Mapping) Grad-CAM technique. This study provides a detailed discussion of the success and failure of the proposed model at an image level. Performance of the model is compared with state-of-the-art DL models and shown to be comparable. The data and code used are available at https://github.com/aleesuss/c19.
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在该研究中,提出了一种具有贝叶斯优化(ADSNN-BO)的关注深度可分离的神经网络,以检测和分类稻米图像的水稻疾病。水稻疾病经常导致20至40%的公司生产损失的产量,与全球经济有关。快速疾病鉴定对于计划及时计划治疗并减​​少CORP损失至关重要。水稻疾病诊断仍然主要是手动进行的。为实现AI辅助快速准确的疾病检测,我们提出了基于MobileNet结构的Adsnn-Bo模型和增强注意机制。此外,贝叶斯优化方法应用于调整模型的超级参数。交叉验证的分类实验是基于公共米病数据集进行的,总共有四个类别。实验结果表明,我们的移动兼容ADSNN-BO模型实现了94.65 \%的测试精度,这占据了所有最先进的模型。为了检查我们所提出的模型的可解释性,还进行了包括激活图和过滤器可视化方法的特征分析。结果表明,我们提出的基于关注机制可以更有效地引导Adsnn-Bo模型学习信息性功能。本研究的结果将促进农业领域快速植物疾病诊断和控制的人工智能。
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随着世界各地的COVID-19病毒感染的下降,Monkeypox病毒正在缓慢地出现。人们害怕它,认为它看起来像是Covid-19的大流行。因此,在广泛的社区传播之前,至关重要的是检测到它们。基于AI的检测可以帮助他们在早期识别它们。在本文中,我们首先比较了13个不同的预训练的深度学习(DL)模型,以检测蒙基氧基病毒。为此,我们首先将它们添加到所有这些层中,并使用四个完善的措施进行分析:精度,召回,F1得分和准确性。在确定了表现最佳的DL模型之后,我们将它们整合以利用从其获得的概率输出的多数投票来提高整体绩效。我们在公开可用的数据集上执行实验,这表明我们的集合方法提供了精度,召回,F1得分和精度为85.44 \%,85.47 \%,85.40 \%和87.13 \%。这些令人鼓舞的结果表明,所提出的方法适用于卫生从业人员进行大规模筛查。
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从侵入性冠状动脉造影(ICA)中准确提取冠状动脉(ICA)在临床决策中对于冠状动脉疾病的诊断和风险分层(CAD)很重要。在这项研究中,我们开发了一种使用深度学习来自动提取冠状动脉腔的方法。方法。提出了一个深度学习模型U-NET 3+,其中包含了全面的跳过连接和深度监督,以自动从ICAS中自动提取冠状动脉。在这个新型的冠状动脉提取框架中采用了转移学习和混合损失功能。结果。使用了一个包含从210名患者获得的616个ICA的数据集。在技​​术评估中,U-NET 3+的骰子得分为0.8942,灵敏度为0.8735,高于U-NET ++(骰子得分:0.8814:0.8814,灵敏度为0.8331)和U-net(骰子分数) :0.8799,灵敏度为0.8305)。结论。我们的研究表明,U-NET 3+优于其他分割框架,用于自动从ICA中提取冠状动脉。该结果表明了临床使用的巨大希望。
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医疗图像分割有助于计算机辅助诊断,手术和治疗。数字化组织载玻片图像用于分析和分段腺,核和其他生物标志物,这些标志物进一步用于计算机辅助医疗应用中。为此,许多研究人员开发了不同的神经网络来对组织学图像进行分割,主要是这些网络基于编码器编码器体系结构,并且还利用了复杂的注意力模块或变压器。但是,这些网络不太准确地捕获相关的本地和全局特征,并在多个尺度下具有准确的边界检测,因此,我们提出了一个编码器折叠网络,快速注意模块和多损耗函数(二进制交叉熵(BCE)损失的组合) ,焦点损失和骰子损失)。我们在两个公开可用数据集上评估了我们提出的网络的概括能力,用于医疗图像分割Monuseg和Glas,并胜过最先进的网络,在Monuseg数据集上提高了1.99%的提高,而GLAS数据集则提高了7.15%。实施代码可在此链接上获得:https://bit.ly/histoseg
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随着深度学习方法的进步,如深度卷积神经网络,残余神经网络,对抗网络的进步。 U-Net架构最广泛利用生物医学图像分割,以解决目标区域或子区域的识别和检测的自动化。在最近的研究中,基于U-Net的方法在不同应用中显示了最先进的性能,以便在脑肿瘤,肺癌,阿尔茨海默,乳腺癌等疾病的早期诊断和治疗中发育计算机辅助诊断系统等,使用各种方式。本文通过描述U-Net框架来提出这些方法的成功,然后通过执行1)型号的U-Net变体进行综合分析,2)模特内分类,建立更好的见解相关的挑战和解决方案。此外,本文还强调了基于U-Net框架在持续的大流行病,严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)中的贡献也称为Covid-19。最后,分析了这些U-Net变体的优点和相似性以及生物医学图像分割所涉及的挑战,以发现该领域的未来未来的研究方向。
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卷积神经网络(CNN)的深度学习体系结构在计算机视野领域取得了杰出的成功。 CNN构建的编码器架构U-Net在生物医学图像分割方面取得了重大突破,并且已在各种实用的情况下应用。但是,编码器部分中每个下采样层和简单堆积的卷积的平等设计不允许U-NET从不同深度提取足够的特征信息。医学图像的复杂性日益增加为现有方法带来了新的挑战。在本文中,我们提出了一个更深层,更紧凑的分裂注意U形网络(DCSAU-NET),该网络有效地利用了基于两个新颖框架的低级和高级语义信息:主要功能保护和紧凑的分裂注意力堵塞。我们评估了CVC-ClinicDB,2018 Data Science Bowl,ISIC-2018和SEGPC-2021数据集的建议模型。结果,DCSAU-NET在联合(MIOU)和F1-SOCRE的平均交点方面显示出比其他最先进的方法(SOTA)方法更好的性能。更重要的是,提出的模型在具有挑战性的图像上表现出了出色的细分性能。我们的工作代码以及更多技术细节,请访问https://github.com/xq141839/dcsau-net。
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人工智能被出现为众多临床应用诊断和治疗决策的有用援助。由于可用数据和计算能力的快速增加,深度神经网络的性能与许多任务中的临床医生相同或更好。为了符合信任AI的原则,AI系统至关重要的是透明,强大,公平和确保责任。由于对决策过程的具体细节缺乏了解,目前的深神经系统被称为黑匣子。因此,需要确保在常规临床工作流中纳入常规神经网络之前的深度神经网络的可解释性。在这一叙述审查中,我们利用系统的关键字搜索和域专业知识来确定已经基于所产生的解释和技术相似性的类型的医学图像分析应用的深度学习模型来确定九种不同类型的可解释方法。此外,我们报告了评估各种可解释方法产生的解释的进展。最后,我们讨论了局限性,提供了利用可解释性方法和未来方向的指导,了解医学成像分析深度神经网络的解释性。
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尽管有无数的同伴审查的论文,证明了新颖的人工智能(AI)基于大流行期间的Covid-19挑战的解决方案,但很少有临床影响。人工智能在Covid-19大流行期间的影响因缺乏模型透明度而受到极大的限制。这种系统审查考察了在大流行期间使用可解释的人工智能(Xai)以及如何使用它可以克服现实世界成功的障碍。我们发现,Xai的成功使用可以提高模型性能,灌输信任在最终用户,并提供影响用户决策所需的值。我们将读者介绍给常见的XAI技术,其实用程序以及其应用程序的具体例子。 XAI结果的评估还讨论了最大化AI的临床决策支持系统的价值的重要步骤。我们说明了Xai的古典,现代和潜在的未来趋势,以阐明新颖的XAI技术的演变。最后,我们在最近出版物支持的实验设计过程中提供了建议的清单。潜在解决方案的具体示例也解决了AI解决方案期间的共同挑战。我们希望本次审查可以作为提高未来基于AI的解决方案的临床影响的指导。
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由于深度学习在放射学领域被广泛使用,因此在使用模型进行诊断时,这种模型的解释性越来越成为获得临床医生的信任至关重要的。在这项研究中,使用U-NET架构进行了三个实验集,以改善分类性能,同时通过在训练过程中结合热图生成器来增强与模型相对应的热图。所有实验均使用包含胸部X光片的数据集,来自三个条件之一(“正常”,“充血性心力衰竭(CHF)”和“肺炎”)的相关标签,以及有关放射科医师眼神坐标的数值信息在图像上。引入该数据集的论文(A. Karargyris和Moradi,2021年)开发了一个U-NET模型,该模型被视为这项研究的基线模型,以显示如何将眼目光数据用于多模式培训中的眼睛凝视数据以进行多模式培训以进行多模式训练。解释性改进。为了比较分类性能,测量了接收器操作特征曲线(AUC)下面积的95%置信区间(CI)。最佳方法的AUC为0.913(CI:0.860-0.966)。最大的改进是“肺炎”和“ CHF”类别,基线模型最努力地进行分类,导致AUCS 0.859(CI:0.732-0.957)和0.962(CI:0.933-0.989)。所提出的方法的解码器还能够产生概率掩模,以突出模型分类中确定的图像部分,类似于放射科医生的眼睛凝视数据。因此,这项工作表明,将热图发生器和眼睛凝视信息纳入训练可以同时改善疾病分类,并提供可解释的视觉效果,与放射线医生在进行诊断时如何看待胸部X光片。
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