贝叶斯正交(BQ)是一种解决贝叶斯方式中数值集成问题的方法,允许用户量化其对解决方案的不确定性。 BQ的标准方法基于Intains的高斯过程(GP)近似。结果,BQ本质上仅限于可以以有效的方式完成GP近似的情况,因此通常禁止非常高维或非平滑的目标功能。本文提出使用基于贝叶斯添加剂回归树(BART)前锋的新的贝叶斯数值集成算法来解决这个问题,我们调用Bart-Int。 BART Priors易于调整,适合不连续的功能。我们证明它们在顺序设计环境中,它们也会自然地借给自己,并且可以在各种设置中获得显式收敛速率。这种新方法的优点和缺点在包括Genz功能的一组基准测试和贝叶斯调查设计问题上突出显示。
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We present the GPry algorithm for fast Bayesian inference of general (non-Gaussian) posteriors with a moderate number of parameters. GPry does not need any pre-training, special hardware such as GPUs, and is intended as a drop-in replacement for traditional Monte Carlo methods for Bayesian inference. Our algorithm is based on generating a Gaussian Process surrogate model of the log-posterior, aided by a Support Vector Machine classifier that excludes extreme or non-finite values. An active learning scheme allows us to reduce the number of required posterior evaluations by two orders of magnitude compared to traditional Monte Carlo inference. Our algorithm allows for parallel evaluations of the posterior at optimal locations, further reducing wall-clock times. We significantly improve performance using properties of the posterior in our active learning scheme and for the definition of the GP prior. In particular we account for the expected dynamical range of the posterior in different dimensionalities. We test our model against a number of synthetic and cosmological examples. GPry outperforms traditional Monte Carlo methods when the evaluation time of the likelihood (or the calculation of theoretical observables) is of the order of seconds; for evaluation times of over a minute it can perform inference in days that would take months using traditional methods. GPry is distributed as an open source Python package (pip install gpry) and can also be found at https://github.com/jonaselgammal/GPry.
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近年来目睹了采用灵活的机械学习模型进行乐器变量(IV)回归的兴趣,但仍然缺乏不确定性量化方法的发展。在这项工作中,我们为IV次数回归提出了一种新的Quasi-Bayesian程序,建立了最近开发的核化IV模型和IV回归的双/极小配方。我们通过在$ l_2 $和sobolev规范中建立最低限度的最佳收缩率,并讨论可信球的常见有效性来分析所提出的方法的频繁行为。我们进一步推出了一种可扩展的推理算法,可以扩展到与宽神经网络模型一起工作。实证评价表明,我们的方法对复杂的高维问题产生了丰富的不确定性估计。
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离散数据丰富,并且通常作为计数或圆形数据而出现。甚至对于线性回归模型,缀合格前沿和闭合形式的后部通常是不可用的,这需要近似诸如MCMC的后部推理。对于广泛的计数和圆形数据回归模型,我们介绍了能够闭合后部推理的共轭前沿。密钥后和预测功能可通过直接蒙特卡罗模拟来计算。至关重要的是,预测分布是离散的,以匹配数据的支持,并且可以在多个协变量中进行共同评估或模拟。这些工具广泛用途是线性回归,非线性模型,通过基础扩展,以及模型和变量选择。多种仿真研究表明计算,预测性建模和相对于现有替代方案的选择性的显着优势。
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剩下的交叉验证(LOO-CV)是一种估计样本外预测准确性的流行方法。但是,由于需要多次拟合模型,因此计算LOO-CV标准在计算上可能很昂贵。在贝叶斯的情况下,重要性采样提供了一种可能的解决方案,但是经典方法可以轻松地产生差异是无限的估计器,从而使它们可能不可靠。在这里,我们提出和分析一种新型混合估计量来计算贝叶斯Loo-CV标准。我们的方法保留了经典方法的简单性和计算便利性,同时保证了所得估计器的有限差异。提供了理论和数值结果,以说明提高的鲁棒性和效率。在高维问题中,计算益处尤为重要,可以为更广泛的模型执行贝叶斯loo-CV。所提出的方法可以在标准概率编程软件中很容易实现,并且计算成本大致相当于拟合原始模型一次。
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高斯流程已成为各种安全至关重要环境的有前途的工具,因为后方差可用于直接估计模型误差并量化风险。但是,针对安全 - 关键环境的最新技术取决于核超参数是已知的,这通常不适用。为了减轻这种情况,我们在具有未知的超参数的设置中引入了强大的高斯过程统一误差界。我们的方法计算超参数空间中的一个置信区域,这使我们能够获得具有任意超参数的高斯过程模型误差的概率上限。我们不需要对超参数的任何界限,这是相关工作中常见的假设。相反,我们能够以直观的方式从数据中得出界限。我们还采用了建议的技术来为一类基于学习的控制问题提供绩效保证。实验表明,界限的性能明显优于香草和完全贝叶斯高斯工艺。
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近几十年来,科学和工程的可用数据数量的重大增长彻底改变了。然而,尽管现在收集和存储数据的空前很容易,但通过补充每个功能的标签来标记数据仍然是具有挑战性的。标签过程需要专家知识或乏味且耗时的说明任务包括用诊断X射线标记X射线,具有蛋白质类型的蛋白质序列,其主题的文本,通过其情感推文或视频通过其类型的视频。在这些和许多其他示例中,由于成本和时间限制,只能手动标记一些功能。我们如何才能最好地将标签信息从少数昂贵的标签功能到大量未标记的标签信息传播?这是半监督学习(SSL)提出的问题。本文概述了基于图的贝叶斯SSL的最新基础发展,这是一种使用功能之间的相似性的标签传播概率框架。 SSL是一个活跃的研究领域,对现有文献的彻底回顾超出了本文的范围。我们的重点将放在我们自己的研究中得出的主题,这些主题说明了对基于图的贝叶斯SSL的统计准确性和计算效率进行严格研究的广泛数学工具和思想。
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Bayesian optimization provides sample-efficient global optimization for a broad range of applications, including automatic machine learning, engineering, physics, and experimental design. We introduce BOTORCH, a modern programming framework for Bayesian optimization that combines Monte-Carlo (MC) acquisition functions, a novel sample average approximation optimization approach, autodifferentiation, and variance reduction techniques. BOTORCH's modular design facilitates flexible specification and optimization of probabilistic models written in PyTorch, simplifying implementation of new acquisition functions. Our approach is backed by novel theoretical convergence results and made practical by a distinctive algorithmic foundation that leverages fast predictive distributions, hardware acceleration, and deterministic optimization. We also propose a novel "one-shot" formulation of the Knowledge Gradient, enabled by a combination of our theoretical and software contributions. In experiments, we demonstrate the improved sample efficiency of BOTORCH relative to other popular libraries.34th Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2020),
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利用启发式来评估收敛性和压缩马尔可夫链蒙特卡罗的输出可以在生产的经验逼近时是次优。通常,许多初始状态归因于“燃烧”并移除,而链条的其余部分是“变薄”,如果还需要压缩。在本文中,我们考虑回顾性地从样本路径中选择固定基数的状态的问题,使得由其经验分布提供的近似接近最佳。提出了一种基于核心稳定性差异的贪婪最小化的新方法,这适用于需要重压力的问题。理论结果保障方法的一致性及其有效性在常微分方程的参数推理的具体背景下证明了该效果。软件可在Python,R和Matlab中的Stein细化包中提供。
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Many scientific and engineering challenges-ranging from personalized medicine to customized marketing recommendations-require an understanding of treatment effect heterogeneity. In this paper, we develop a non-parametric causal forest for estimating heterogeneous treatment effects that extends Breiman's widely used random forest algorithm. In the potential outcomes framework with unconfoundedness, we show that causal forests are pointwise consistent for the true treatment effect, and have an asymptotically Gaussian and centered sampling distribution. We also discuss a practical method for constructing asymptotic confidence intervals for the true treatment effect that are centered at the causal forest estimates. Our theoretical results rely on a generic Gaussian theory for a large family of random forest algorithms. To our knowledge, this is the first set of results that allows any type of random forest, including classification and regression forests, to be used for provably valid statistical inference. In experiments, we find causal forests to be substantially more powerful than classical methods based on nearest-neighbor matching, especially in the presence of irrelevant covariates.
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The Bayesian additive regression trees (BART) model is an ensemble method extensively and successfully used in regression tasks due to its consistently strong predictive performance and its ability to quantify uncertainty. BART combines "weak" tree models through a set of shrinkage priors, whereby each tree explains a small portion of the variability in the data. However, the lack of smoothness and the absence of a covariance structure over the observations in standard BART can yield poor performance in cases where such assumptions would be necessary. We propose Gaussian processes Bayesian additive regression trees (GP-BART) as an extension of BART which assumes Gaussian process (GP) priors for the predictions of each terminal node among all trees. We illustrate our model on simulated and real data and compare its performance to traditional modelling approaches, outperforming them in many scenarios. An implementation of our method is available in the R package rGPBART available at: https://github.com/MateusMaiaDS/gpbart
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标准GPS为行为良好的流程提供了灵活的建模工具。然而,预计与高斯的偏差有望在现实世界数据集中出现,结构异常值和冲击通常会观察到。在这些情况下,GP可能无法充分建模不确定性,并且可能会过度推动。在这里,我们将GP框架扩展到一类新的时间变化的GP,从而可以直接建模重尾非高斯行为,同时通过非均匀GPS表示的无限混合物保留了可拖动的条件GP结构。有条件的GP结构是通过在潜在转化的输入空间上调节观测值来获得的,并使用L \'{e} Vy过程对潜在转化的随机演变进行建模,该过程允许贝叶斯在后端预测密度和潜在转化中的贝叶斯推断功能。我们为该模型提供了马尔可夫链蒙特卡洛推理程序,并证明了与标准GP相比的潜在好处。
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在过去几十年中,已经提出了各种方法,用于估计回归设置中的预测间隔,包括贝叶斯方法,集合方法,直接间隔估计方法和保形预测方法。重要问题是这些方法的校准:生成的预测间隔应该具有预定义的覆盖水平,而不会过于保守。在这项工作中,我们从概念和实验的角度审查上述四类方法。结果来自各个域的基准数据集突出显示从一个数据集中的性能的大波动。这些观察可能归因于违反某些类别的某些方法所固有的某些假设。我们说明了如何将共形预测用作提供不具有校准步骤的方法的方法的一般校准程序。
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贝叶斯后期和模型证据的计算通常需要数值整合。贝叶斯正交(BQ)是一种基于替代模型的数值整合方法,能够具有出色的样品效率,但其缺乏并行化阻碍了其实际应用。在这项工作中,我们提出了一种并行的(批次)BQ方法,该方法采用了核正素的技术,该技术具有证明是指数的收敛速率。另外,与嵌套采样一样,我们的方法允许同时推断后期和模型证据。重新选择了来自BQ替代模型的样品,通过内核重组算法获得一组稀疏的样品,需要可忽略的额外时间来增加批处理大小。从经验上讲,我们发现我们的方法显着优于在包括锂离子电池分析在内的各种现实世界数据集中,最先进的BQ技术和嵌套采样的采样效率。
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潜在位置网络模型是网络科学的多功能工具;应用程序包括集群实体,控制因果混淆,并在未观察的图形上定义前提。估计每个节点的潜在位置通常是贝叶斯推理问题的群体,吉布斯内的大都市是最流行的近似后分布的工具。然而,众所周知,GIBBS内的大都市对于大型网络而言是低效;接受比计算成本昂贵,并且所得到的后绘高度相关。在本文中,我们提出了一个替代的马尔可夫链蒙特卡罗战略 - 使用分裂哈密顿蒙特卡罗和萤火虫蒙特卡罗的组合定义 - 利用后部分布的功能形式进行更有效的后退计算。我们展示了这些战略在吉布斯和综合网络上的其他算法中优于大都市,以及学区的教师和工作人员的真正信息共享网络。
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这是模型选择和假设检测的边缘似然计算的最新介绍和概述。计算概率模型(或常量比率)的常规规定常数是许多统计数据,应用数学,信号处理和机器学习中的许多应用中的基本问题。本文提供了对主题的全面研究。我们突出了不同技术之间的局限性,优势,连接和差异。还描述了使用不正确的前沿的问题和可能的解决方案。通过理论比较和数值实验比较一些最相关的方法。
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我们引入了重新定性,这是一种数据依赖性的重新聚集化,将贝叶斯神经网络(BNN)转化为后部的分布,其KL对BNN对BNN的差异随着层宽度的增长而消失。重新定义图直接作用于参数,其分析简单性补充了宽BNN在功能空间中宽BNN的已知神经网络过程(NNGP)行为。利用重新定性,我们开发了马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)后采样算法,该算法将BNN更快地混合在一起。这与MCMC在高维度上的表现差异很差。对于完全连接和残留网络,我们观察到有效样本量高达50倍。在各个宽度上都取得了改进,并在层宽度的重新培训和标准BNN之间的边缘。
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贝叶斯神经网络试图将神经网络的强大预测性能与与贝叶斯架构预测产出相关的不确定性的正式量化相结合。然而,它仍然不清楚如何在升入网络的输出空间时,如何赋予网络的参数。提出了一种可能的解决方案,使用户能够为手头的任务提供适当的高斯过程协方差函数。我们的方法构造了网络参数的先前分配,称为ridgelet,它近似于网络的输出空间中的Posited高斯过程。与神经网络和高斯过程之间的连接的现有工作相比,我们的分析是非渐近的,提供有限的样本大小的错误界限。这建立了贝叶斯神经网络可以近似任何高斯过程,其协方差函数是足够规律的任何高斯过程。我们的实验评估仅限于概念验证,在那里我们证明ridgele先前可以在可以提供合适的高斯过程的回归问题之前出现非结构化。
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在本文中,我们考虑了贝叶斯(DNNS),尤其是Trace-Class神经网络(TNN)先验,贝叶斯的推论是Sell等人提出的。 [39]。在推理问题的背景下,这种先验是对经典体系结构的更强大替代品。对于这项工作,我们为此类模型开发了多级蒙特卡洛(MLMC)方法。 MLMC是一种流行的差异技术,在贝叶斯统计和不确定性定量中具有特殊应用。我们展示了在[4]中引入的特定高级MLMC方法如何应用于DNN的贝叶斯推断并从数学上确定,即实现特定平方误差的计算成本,与后验预期相关,可以通过几个减少订单,与更常规的技术。为了验证此类结果,我们提供了许多关于机器学习中产生的模型问题的数值实验。其中包括贝叶斯回归,以及贝叶斯分类和增强学习。
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Multivariate Hawkes processes are temporal point processes extensively applied to model event data with dependence on past occurrences and interaction phenomena. In the generalised nonlinear model, positive and negative interactions between the components of the process are allowed, therefore accounting for so-called excitation and inhibition effects. In the nonparametric setting, learning the temporal dependence structure of Hawkes processes is often a computationally expensive task, all the more with Bayesian estimation methods. In general, the posterior distribution in the nonlinear Hawkes model is non-conjugate and doubly intractable. Moreover, existing Monte-Carlo Markov Chain methods are often slow and not scalable to high-dimensional processes in practice. Recently, efficient algorithms targeting a mean-field variational approximation of the posterior distribution have been proposed. In this work, we unify existing variational Bayes inference approaches under a general framework, that we theoretically analyse under easily verifiable conditions on the prior, the variational class, and the model. We notably apply our theory to a novel spike-and-slab variational class, that can induce sparsity through the connectivity graph parameter of the multivariate Hawkes model. Then, in the context of the popular sigmoid Hawkes model, we leverage existing data augmentation technique and design adaptive and sparsity-inducing mean-field variational methods. In particular, we propose a two-step algorithm based on a thresholding heuristic to select the graph parameter. Through an extensive set of numerical simulations, we demonstrate that our approach enjoys several benefits: it is computationally efficient, can reduce the dimensionality of the problem by selecting the graph parameter, and is able to adapt to the smoothness of the underlying parameter.
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