Mitosis nuclei count is one of the important indicators for the pathological diagnosis of breast cancer. The manual annotation needs experienced pathologists, which is very time-consuming and inefficient. With the development of deep learning methods, some models with good performance have emerged, but the generalization ability should be further strengthened. In this paper, we propose a two-stage mitosis segmentation and classification method, named SCMitosis. Firstly, the segmentation performance with a high recall rate is achieved by the proposed depthwise separable convolution residual block and channel-spatial attention gate. Then, a classification network is cascaded to further improve the detection performance of mitosis nuclei. The proposed model is verified on the ICPR 2012 dataset, and the highest F-score value of 0.8687 is obtained compared with the current state-of-the-art algorithms. In addition, the model also achieves good performance on GZMH dataset, which is prepared by our group and will be firstly released with the publication of this paper. The code will be available at: https://github.com/antifen/mitosis-nuclei-segmentation.
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人行道表面数据的获取和评估在路面条件评估中起着至关重要的作用。在本文中,提出了一个称为RHA-NET的自动路面裂纹分割的有效端到端网络,以提高路面裂纹分割精度。 RHA-NET是通过将残留块(重阻)和混合注意块集成到编码器架构结构中来构建的。这些重组用于提高RHA-NET提取高级抽象特征的能力。混合注意块旨在融合低级功能和高级功能,以帮助模型专注于正确的频道和裂纹区域,从而提高RHA-NET的功能表现能力。构建并用于训练和评估所提出的模型的图像数据集,其中包含由自设计的移动机器人收集的789个路面裂纹图像。与其他最先进的网络相比,所提出的模型在全面的消融研究中验证了添加残留块和混合注意机制的功能。此外,通过引入深度可分离卷积生成的模型的轻加权版本可以更好地实现性能和更快的处理速度,而U-NET参数数量的1/30。开发的系统可以在嵌入式设备Jetson TX2(25 fps)上实时划分路面裂纹。实时实验拍摄的视频将在https://youtu.be/3xiogk0fig4上发布。
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组织学图像中核和腺体的实例分割是用于癌症诊断,治疗计划和生存分析的计算病理学工作流程中的重要一步。随着现代硬件的出现,大规模质量公共数据集的最新可用性以及社区组织的宏伟挑战已经看到了自动化方法的激增,重点是特定领域的挑战,这对于技术进步和临床翻译至关重要。在这项调查中,深入分析了过去五年(2017-2022)中发表的原子核和腺体实例细分的126篇论文,进行了深入分析,讨论了当前方法的局限性和公开挑战。此外,提出了潜在的未来研究方向,并总结了最先进方法的贡献。此外,还提供了有关公开可用数据集的概括摘要以及关于说明每种挑战的最佳性能方法的巨大挑战的详细见解。此外,我们旨在使读者现有研究的现状和指针在未来的发展方向上开发可用于临床实践的方法,从而可以改善诊断,分级,预后和癌症的治疗计划。据我们所知,以前没有工作回顾了朝向这一方向的组织学图像中的实例细分。
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脑肿瘤分割是医学图像分析中最具挑战性问题之一。脑肿瘤细分的目标是产生准确描绘脑肿瘤区域。近年来,深入学习方法在解决各种计算机视觉问题时表现出了有希望的性能,例如图像分类,对象检测和语义分割。基于深度学习的方法已经应用于脑肿瘤细分并取得了有希望的结果。考虑到最先进技术所制作的显着突破,我们使用本调查来提供最近开发的深层学习脑肿瘤分割技术的全面研究。在本次调查中选择并讨论了100多篇科学论文,广泛地涵盖了网络架构设计,在不平衡条件下的细分等技术方面,以及多种方式流程。我们还为未来的发展方向提供了富有洞察力的讨论。
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深度学习已被广​​泛用于医学图像分割,并且录制了录制了该领域深度学习的成功的大量论文。在本文中,我们使用深层学习技术对医学图像分割的全面主题调查。本文进行了两个原创贡献。首先,与传统调查相比,直接将深度学习的文献分成医学图像分割的文学,并为每组详细介绍了文献,我们根据从粗略到精细的多级结构分类目前流行的文献。其次,本文侧重于监督和弱监督的学习方法,而不包括无监督的方法,因为它们在许多旧调查中引入而且他们目前不受欢迎。对于监督学习方法,我们分析了三个方面的文献:骨干网络的选择,网络块的设计,以及损耗功能的改进。对于虚弱的学习方法,我们根据数据增强,转移学习和交互式分割进行调查文献。与现有调查相比,本调查将文献分类为比例不同,更方便读者了解相关理由,并将引导他们基于深度学习方法思考医学图像分割的适当改进。
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由于不规则的形状,正常和感染组织之间的各种尺寸和无法区分的边界,仍然是一种具有挑战性的任务,可以准确地在CT图像上进行Covid-19的感染病变。在本文中,提出了一种新的分段方案,用于通过增强基于编码器 - 解码器架构的不同级别的监督信息和融合多尺度特征映射来感染Covid-19。为此,提出了深入的协作监督(共同监督)计划,以指导网络学习边缘和语义的特征。更具体地,首先设计边缘监控模块(ESM),以通过将边缘监督信息结合到初始阶段的下采样的初始阶段来突出显示低电平边界特征。同时,提出了一种辅助语义监督模块(ASSM)来加强通过将掩码监督信息集成到稍后阶段来加强高电平语义信息。然后,通过使用注意机制来扩展高级和低电平特征映射之间的语义间隙,开发了一种注意融合模块(AFM)以融合不同级别的多个规模特征图。最后,在四个各种Covid-19 CT数据集上证明了所提出的方案的有效性。结果表明,提出的三个模块都是有希望的。基于基线(RESUNT),单独使用ESM,ASSM或AFM可以分别将骰子度量增加1.12 \%,1.95 \%,1.63 \%,而在我们的数据集中,通过将三个模型结合在一起可以上升3.97 \% 。与各个数据集的现有方法相比,所提出的方法可以在某些主要指标中获得更好的分段性能,并可实现最佳的泛化和全面的性能。
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卷积神经网络(CNN)的深度学习体系结构在计算机视野领域取得了杰出的成功。 CNN构建的编码器架构U-Net在生物医学图像分割方面取得了重大突破,并且已在各种实用的情况下应用。但是,编码器部分中每个下采样层和简单堆积的卷积的平等设计不允许U-NET从不同深度提取足够的特征信息。医学图像的复杂性日益增加为现有方法带来了新的挑战。在本文中,我们提出了一个更深层,更紧凑的分裂注意U形网络(DCSAU-NET),该网络有效地利用了基于两个新颖框架的低级和高级语义信息:主要功能保护和紧凑的分裂注意力堵塞。我们评估了CVC-ClinicDB,2018 Data Science Bowl,ISIC-2018和SEGPC-2021数据集的建议模型。结果,DCSAU-NET在联合(MIOU)和F1-SOCRE的平均交点方面显示出比其他最先进的方法(SOTA)方法更好的性能。更重要的是,提出的模型在具有挑战性的图像上表现出了出色的细分性能。我们的工作代码以及更多技术细节,请访问https://github.com/xq141839/dcsau-net。
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肝癌是世界上最常见的恶性疾病之一。 CT图像中肝脏肿瘤和血管的分割和标记可以为肝脏肿瘤诊断和手术干预中的医生提供便利。在过去的几十年中,基于深度学习的自动CT分段方法在医学领域得到了广泛的关注。在此期间出现了许多最先进的分段算法。然而,大多数现有的分割方法只关心局部特征背景,并在医学图像的全局相关性中具有感知缺陷,这显着影响了肝脏肿瘤和血管的分割效果。我们引入了一种基于变压器和SebottLenet的多尺度特征上下文融合网络,称为TransFusionNet。该网络可以准确地检测和识别肝脏容器的兴趣区域的细节,同时它可以通过利用CT图像的全球信息来改善肝肿瘤的形态边缘的识别。实验表明,TransFusionNet优于公共数据集LITS和3DIRCADB以及我们的临床数据集的最先进方法。最后,我们提出了一种基于训练模型的自动三维重建算法。该算法可以在1秒内快速准确地完成重建。
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肝脏的准确细分是诊断疾病的先决条件。自动分割是计算机辅助检测和肝病诊断的重要应用。近年来,医学图像的自动化处理已经取得了突破。然而,腹部扫描CT图像的低对比度和肝脏形态的复杂性使得精确的自动分割具有挑战性。在本文中,我们提出了RA V-NET,这是基于U-Net的改进的医学图像自动分割模型。它有以下三个主要创新。建议Cofres模块(复合原始功能剩余模块)。通过更复杂的卷积层和跳过连接,使其获得更高级别的图像特征提取功能并防止梯度消失或爆炸。建议AR模块(注意恢复模块)以减少模型的计算工作。另外,通过调整通道和LSTM卷积来感测编码和解码模块的数据像素之间的空间特征。最后,有效地保留了图像特征。介绍了CA模块(通道注意模块),用于提取具有依赖性的相关通道,并通过矩阵点产品加强它们,同时在没有依赖性的情况下削弱无关的通道。达到关注的目的。 LSTM卷积和CA模块提供的注意机制是强证神经网络性能的保证。 U-Net网络的准确性:0.9862,精确度:0.9118,DSC:0.8547,JSC:0.82。 RA V-NET的评估指标,精度:0.9968,精确度:0.9597,DSC:0.9654,JSC:0.9414。分割效果的最代表性度量是DSC,其在U-NET上改善0.1107,JSC改善0.1214。
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MRI图像中的脑肿瘤分析是一个重要而挑战性的问题,因为误诊可能导致死亡。脑肿瘤在早期阶段的诊断和评估增加了成功治疗的概率。然而,肿瘤,形状和位置的复杂性和各种使其分割和分类复合物。在这方面,许多研究人员提出了脑肿瘤细分和分类方法。本文使用含有MRI图像增强和肿瘤区检测的框架,呈现了一种同时分段和分类MRI图像中的脑肿瘤的方法。最终,提出了一种基于多任务学习方法的网络。主观和客观结果表明,基于评估指标的分割和分类结果更好或与最先进的。
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超声成像在诊断血管病变中起重要作用。血管壁的准确分割对于预防,诊断和治疗血管疾病很重要。但是,现有方法的血管壁边界的定位不准确。分割误差发生在不连续的血管壁边界和黑暗边界中。为了克服这些问题,我们提出了一个新的边界限制网络(BDNET)。我们使用边界细化模块重新限制血管壁的边界以获得正确的边界位置。我们设计了特征提取模块来提取和融合多尺度特征和不同的接受场功能,以解决黑暗边界和不连续边界的问题。我们使用新的损失函数来优化模型。级别不平衡对模型优化的干扰可阻止获得更细致,更光滑的边界。最后,为了促进临床应用,我们将模型设计为轻量级。实验结果表明,与数据集的现有模型相比,我们的模型可实现最佳的分割结果,并显着降低记忆消耗。
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随着深度学习方法的进步,如深度卷积神经网络,残余神经网络,对抗网络的进步。 U-Net架构最广泛利用生物医学图像分割,以解决目标区域或子区域的识别和检测的自动化。在最近的研究中,基于U-Net的方法在不同应用中显示了最先进的性能,以便在脑肿瘤,肺癌,阿尔茨海默,乳腺癌等疾病的早期诊断和治疗中发育计算机辅助诊断系统等,使用各种方式。本文通过描述U-Net框架来提出这些方法的成功,然后通过执行1)型号的U-Net变体进行综合分析,2)模特内分类,建立更好的见解相关的挑战和解决方案。此外,本文还强调了基于U-Net框架在持续的大流行病,严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-COV-2)中的贡献也称为Covid-19。最后,分析了这些U-Net变体的优点和相似性以及生物医学图像分割所涉及的挑战,以发现该领域的未来未来的研究方向。
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居住在美国的每个妇女在8次发育侵袭性乳腺癌的可能性下有大约1。有丝分裂细胞计数是评估乳腺癌侵袭性或等级最常见的测试之一。在该预后,必须通过病理学家使用高分辨率显微镜检查组织病理学图像以计算细胞。不幸的是,可以是一种完整的任务,可重复性差,特别是对于非专家来说。最近深入学习网络适用于能够自动定位这些感兴趣区域的医学应用。然而,这些基于区域的网络缺乏利用通常用作唯一检测方法的完整图像CNN产生的分割特征的能力。因此,所提出的方法利用更快的RCNN进行对象检测,同时使用RGB图像特征的UNET产生的分割特征,以实现在Mitos-Atypia 2014分数上的F分数为0.508,计数数据集,优于最先进的攻击方法。
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鼻咽癌(NPC)是一种恶性肿瘤。在计算断层扫描(CT)图像的风险(OAR)的准确和自动分割(桨)是临床显着的。近年来,U-Net代表的深度学习模型已广泛应用于医学图像分割任务,这可以帮助医生减少工作量并更快地获得准确的结果。在NPC的OAR分割中,OAR的大小是可变的,特别是其中一些是小的。由于缺乏使用全局和多尺寸信息,传统的深神经网络在分割期间表现不佳。本文提出了一种新的SE连接金字塔网络(SECP-NET)。 SECP-Net提取全局和多尺寸信息流,使用SE连接(SEC)模块和网络的金字塔结构,用于改善分割性能,尤其是小器官。 SECP-NET还设计了一种自动上下文级联网络,以进一步提高分段性能。比较实验在SECP-NET和其他最近方法的与头部和颈部的CT图像上的数据集进行。五倍的交叉验证用于根据两个度量,即骰子和jaccard相似性来评估性能。实验结果表明,SECP-Net可以在这项挑战任务中实现SOTA性能。
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晶体中砂岩的晶粒分割从其周围基质/水泥划分薄片是计算机辅助矿物识别和砂岩分类的主要步骤。砂岩的显微图像含有许多矿物颗粒及其周围的基质/水泥。相邻谷物和基质之间的区别通常是模糊的,使晶粒分割困难。文献中存在各种解决方案来处理这些问题;然而,他们对砂岩岩画的不同模式并不强大。在本文中,我们将谷物分割制定为像素 - 明智的两类(即谷物和背景)语义分割任务。我们开发一个基于深度学习的端到端培训框架,名为Deep语义粒度分割网络(DSGSN),数据驱动方法,提供通用解决方案。根据作者的知识,这是探索深度神经网络来解决谷物分割问题的第一个工作。对微观图像的广泛实验强调我们的方法比具有更多参数的各种分段架构获得更好的分割精度。
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Image segmentation is a key topic in image processing and computer vision with applications such as scene understanding, medical image analysis, robotic perception, video surveillance, augmented reality, and image compression, among many others. Various algorithms for image segmentation have been developed in the literature. Recently, due to the success of deep learning models in a wide range of vision applications, there has been a substantial amount of works aimed at developing image segmentation approaches using deep learning models. In this survey, we provide a comprehensive review of the literature at the time of this writing, covering a broad spectrum of pioneering works for semantic and instance-level segmentation, including fully convolutional pixel-labeling networks, encoder-decoder architectures, multi-scale and pyramid based approaches, recurrent networks, visual attention models, and generative models in adversarial settings. We investigate the similarity, strengths and challenges of these deep learning models, examine the most widely used datasets, report performances, and discuss promising future research directions in this area.
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伤口图像分割是伤口临床诊断和时间治疗的关键成分。最近,深度学习已成为伤口图像分割的主流方法。但是,在训练阶段之前,需要进行伤口图像的预处理,例如照明校正,因为可以大大提高性能。校正程序和深层模型的训练是彼此独立的,这导致了次优的分割性能,因为固定的照明校正可能不适合所有图像。为了解决上述问题,本文提出了一种端到端的双视分段方法,通过将可学习的照明校正模块纳入深度细分模型中。可以在训练阶段自动学习和更新模块的参数,而双视融合可以完全利用RAW图像和增强图像的功能。为了证明拟议框架的有效性和鲁棒性,在基准数据集上进行了广泛的实验。令人鼓舞的结果表明,与最先进的方法相比,我们的框架可以显着改善细分性能。
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自动图像分割技术对于视觉分析至关重要。自动编码器体系结构在各种图像分割任务中具有令人满意的性能。但是,基于卷积神经网络(CNN)的自动编码器似乎在提高语义分割的准确性方面遇到了瓶颈。增加前景和背景之间的类间距离是分割网络的固有特征。但是,分割网络过于关注前景和背景之间的主要视觉差异,而忽略了详细的边缘信息,从而导致边缘分割的准确性降低。在本文中,我们提出了一个基于多任务学习的轻量级端到端细分框架,称为Edge Coasity AutoCododer Network(EAA-NET),以提高边缘细分能力。我们的方法不仅利用分割网络来获得类间特征,而且还采用重建网络来提取前景中的类内特征。我们进一步设计了一个阶层和类间特征融合模块-I2融合模块。 I2融合模块用于合并课内和类间特征,并使用软注意机制去除无效的背景信息。实验结果表明,我们的方法在医疗图像分割任务中的表现良好。 EAA-NET易于实现,并且计算成本较小。
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Deep learning has made a breakthrough in medical image segmentation in recent years due to its ability to extract high-level features without the need for prior knowledge. In this context, U-Net is one of the most advanced medical image segmentation models, with promising results in mammography. Despite its excellent overall performance in segmenting multimodal medical images, the traditional U-Net structure appears to be inadequate in various ways. There are certain U-Net design modifications, such as MultiResUNet, Connected-UNets, and AU-Net, that have improved overall performance in areas where the conventional U-Net architecture appears to be deficient. Following the success of UNet and its variants, we have presented two enhanced versions of the Connected-UNets architecture: ConnectedUNets+ and ConnectedUNets++. In ConnectedUNets+, we have replaced the simple skip connections of Connected-UNets architecture with residual skip connections, while in ConnectedUNets++, we have modified the encoder-decoder structure along with employing residual skip connections. We have evaluated our proposed architectures on two publicly available datasets, the Curated Breast Imaging Subset of Digital Database for Screening Mammography (CBIS-DDSM) and INbreast.
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由于图像的复杂性和活细胞的时间变化,来自明亮场光显微镜图像的活细胞分割具有挑战性。最近开发的基于深度学习(DL)的方法由于其成功和有希望的结果而在医学和显微镜图像分割任务中变得流行。本文的主要目的是开发一种基于U-NET的深度学习方法,以在明亮场传输光学显微镜中分割HeLa系的活细胞。为了找到适合我们数据集的最合适的体系结构,提出了剩余的注意U-net,并将其与注意力和简单的U-NET体系结构进行了比较。注意机制突出了显着的特征,并抑制了无关图像区域中的激活。残余机制克服了消失的梯度问题。对于简单,注意力和剩余的关注U-NET,我们数据集的平均值得分分别达到0.9505、0.9524和0.9530。通过将残留和注意机制应用在一起,在平均值和骰子指标中实现了最准确的语义分割结果。应用的分水岭方法适用于这种最佳的(残留的关注)语义分割结果,使每个单元格的特定信息进行了分割。
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