随着深度学习(DL)的引入,常用心电图(ECG)诊断模型的性能改善。但是,尚未充分研究多个DL组件的各种组合和/或数据增强技术对诊断的作用的影响。这项研究提出了一种基于集合的多视图学习方法,采用ECG增强技术,比传统的12级ECG诊断方法获得更高的性能。数据分析结果表明,所提出的模型报告的F1得分为0.840,这表现优于文献中现有的最新方法。
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心电图(ECG)是用于监测心脏电信号和评估其功能的最常见和常规诊断工具。人心脏可能患有多种疾病,包括心律不齐。心律不齐是一种不规则的心律,在严重的情况下会导致心脏中风,可以通过ECG记录诊断。由于早期发现心律不齐非常重要,因此在过去的几十年中,计算机化和自动化的分类以及这些异常心脏信号的识别引起了很多关注。方法:本文引入了一种轻度的深度学习方法,以高精度检测8种不同的心律不齐和正常节奏。为了利用深度学习方法,将重新采样和基线徘徊清除技术应用于ECG信号。在这项研究中,将500个样本ECG段用作模型输入。节奏分类是通过11层网络以端到端方式完成的,而无需手工制作的手动功能提取。结果:为了评估提出的技术,从两个Physionet数据库,MIT-BIH心律失常数据库和长期AF数据库中选择了ECG信号。基于卷积神经网络(CNN)和长期记忆(LSTM)的组合,提出的深度学习框架比大多数最先进的方法显示出令人鼓舞的结果。所提出的方法达到98.24%的平均诊断准确性。结论:成功开发和测试了使用多种心电图信号的心律失常分类的训练有素的模型。意义:由于本工作使用具有高诊断精度的光分类技术与其他值得注意的方法相比,因此可以在Holter Monitor设备中成功实施以进行心律失常检测。
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Time Series Classification (TSC) is an important and challenging problem in data mining. With the increase of time series data availability, hundreds of TSC algorithms have been proposed. Among these methods, only a few have considered Deep Neural Networks (DNNs) to perform this task. This is surprising as deep learning has seen very successful applications in the last years. DNNs have indeed revolutionized the field of computer vision especially with the advent of novel deeper architectures such as Residual and Convolutional Neural Networks. Apart from images, sequential data such as text and audio can also be processed with DNNs to reach state-of-the-art performance for document classification and speech recognition. In this article, we study the current state-ofthe-art performance of deep learning algorithms for TSC by presenting an empirical study of the most recent DNN architectures for TSC. We give an overview of the most successful deep learning applications in various time series domains under a unified taxonomy of DNNs for TSC. We also provide an open source deep learning framework to the TSC community where we implemented each of the compared approaches and evaluated them on a univariate TSC benchmark (the UCR/UEA archive) and 12 multivariate time series datasets. By training 8,730 deep learning models on 97 time series datasets, we propose the most exhaustive study of DNNs for TSC to date.
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睡眠呼吸暂停(SA)是一种睡眠障碍,其特征是打s和慢性睡眠,这可能导致严重的疾病,例如高血压,心力衰竭和心肌病(心脏肌肉组织的增大)。心电图(ECG)在识别SA中起着至关重要的作用,因为它可能显示出异常的心脏活性。对基于ECG的SA检测的最新研究集中在功能工程技术上,这些技术从多铅ECG信号中提取特定特征,并将其用作分类模型输入。在这项研究中,提出了一种基于S峰检测的新型特征提取方法,以增强使用单铅ECG对相邻SA段的检测。特别是,使用单个铅(V2)收集的ECG特征用于识别SA发作。在提取的功能上,对CNN模型进行了训练以检测SA。实验结果表明,所提出的方法从单铅ECG数据中检测到SA比现有的最新方法更准确,具有91.13%的分类精度,敏感性为92.58%和88.75%的特异性。此外,与S峰相关的特征的进一步使用可以提高分类准确性0.85%。我们的发现表明,提出的机器学习系统有可能成为检测SA发作的有效方法。
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睡眠是一种基本的生理过程,对于维持健康的身心至关重要。临床睡眠监测的黄金标准是多核桃摄影(PSG),基于哪个睡眠可以分为五个阶段,包括尾脉冲睡眠(REM睡眠)/非REM睡眠1(N1)/非REM睡眠2 (n2)/非REM睡眠3(n3)。然而,PSG昂贵,繁重,不适合日常使用。对于长期睡眠监测,无处不在的感测可以是解决方案。最近,心脏和运动感测在分类三阶段睡眠方面变得流行,因为两种方式都可以从研究级或消费者级设备中获得(例如,Apple Watch)。但是,为最大准确性融合数据的最佳仍然是一个打开的问题。在这项工作中,我们综合地研究了深度学习(DL)的高级融合技术,包括三种融合策略,三个融合方法以及三级睡眠分类,基于两个公共数据集。实验结果表明,通过融合心脏/运动传感方式可以可靠地分类三阶段睡眠,这可能成为在睡眠中进行大规模睡眠阶段评估研究或长期自动跟踪的实用工具。为了加快普遍存在/可穿戴计算社区的睡眠研究的进展,我们制作了该项目开源,可以在:https://github.com/bzhai/ubi-sleepnet找到代码。
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自动睡眠评分对于诊断和治疗睡眠障碍至关重要,并在家庭环境中实现纵向睡眠跟踪。通常,对单渠道脑电图(EEG)进行基于学习的自动睡眠评分是积极研究的,因为困难在睡眠过程中获得多通道信号。但是,由于以下问题,来自原始脑电图信号的学习表示形式挑战:1)与睡眠相关的脑电图模式发生在不同的时间和频率尺度上,2)睡眠阶段共享相似的脑电图模式。为了解决这些问题,我们提出了一个名为Sleepyco的深度学习框架,该框架结合了1)功能金字塔和2)自动睡眠评分的监督对比度学习。对于特征金字塔,我们提出了一个名为sleepyco-backbone的骨干网络,以考虑在不同的时间和频率尺度上的多个特征序列。监督的对比学习允许网络通过最大程度地降低类内部特征之间的距离并同时最大程度地提高阶层间特征之间的距离来提取类别特征。对四个公共数据集的比较分析表明,Sleepyco始终优于基于单渠道EEG的现有框架。广泛的消融实验表明,Sleepyco表现出增强的总体表现,N1和快速眼运动(REM)阶段之间的歧视有了显着改善。
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背景:12个引线ECG是心血管疾病的核心诊断工具。在这里,我们描述并分析了一个集成的深度神经网络架构,从12个引导eCG分类了24个心脏异常。方法:我们提出了挤压和激发reset,以自动学习来自12个引主ECG的深度特征,以识别24个心脏病。在最终完全连接的层中,随着年龄和性别特征增强了深度特征。使用约束网格搜索设置每个类的输出阈值。为了确定为什么该模型的预测不正确,两个专家诊所人员独立地解释了一组关于左轴偏差的一次无序的ECG。结果:采用定制加权精度度量,我们达到了0.684的5倍交叉验证得分,灵敏度和特异性分别为0.758和0.969。我们在完整的测试数据中得分0.520,并在官方挑战排名中排名第21中。在一系列被错误分类的心电图中,两个临床医生和训练标签之间的协议差(临床医生1:Kappa = -0.057,临床医生2:Kappa = -0.159)。相比之下,临床医生之间的协议非常高(Kappa = 0.92)。讨论:与在相同数据上培训的模型相比,所提出的预测模型很好地对验证和隐藏的测试数据进行了良好。我们还发现培训标签的相当不一致,这可能会阻碍更准确的模型的开发。
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心血管疾病(CVD)是一组心脏和血管疾病,是对人类健康最严重的危险之一,此类患者的数量仍在增长。早期,准确的检测在成功治疗和干预中起着关键作用。心电图(ECG)是识别各种心血管异常的金标准。在临床实践和当前大多数研究中,主要使用标准的12铅ECG。但是,使用较少的铅可以使ECG更加普遍,因为可以通过便携式或可穿戴设备来方便地记录它。在这项研究中,我们开发了一种新颖的深度学习系统,以仅使用三个ECG铅来准确识别多个心血管异常。
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传统机器学习方法面临两种主要挑战,在处理医疗保健预测分析任务方面。首先,医疗保健数据的高维性质需要劳动密集型和耗时的过程,为每项新任务选择适当的功能集。其次,这些方法依赖于特征工程来捕获患者数据的顺序性,这可能无法充分利用医疗事件的时间模式及其依赖性。最近的深度学习方法通​​过解决医疗数据的高维和时间挑战,对各种医疗保健预测任务显示了有希望的性能。这些方法可以学习关键因素(例如,医学概念或患者)的有用表示及其与高维原始或最低处理的医疗保健数据的相互作用。在本文中,我们系统地审查了专注于推进和使用深神经网络的研究,以利用患者结构化时间序列数据进行医疗保健预测任务。为了识别相关研究,搜索MEDLINE,IEEE,SCOPUS和ACM数字图书馆于2021年2月7日出版的研究。我们发现研究人员在十个研究流中为深度时间序列预测文献做出了贡献:深入学习模型,缺少价值处理,不规则处理,患者表示,静态数据包容,关注机制,解释,纳入医疗本体,学习策略和可扩展性。本研究总结了这些文献流的研究见解,确定了几个关键研究差距,并提出了未来的患者时间序列数据深入学习的研究机会。
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背景:基于AI的足够大型,精心策划的医疗数据集的分析已被证明有望提供早期检测,更快的诊断,更好的决策和更有效的治疗方法。但是,从多种来源获得的如此高度机密且非常敏感的医疗数据通常受到高度限制,因为不当使用,不安全的存储,数据泄漏或滥用可能侵犯了一个人的隐私。在这项工作中,我们将联合学习范式应用于异质的,孤立的高清心电图集,该图从12铅的ECG传感器阵列到达来训练AI模型。与在中心位置收集相同的数据时,我们评估了所得模型的能力,与经过训练的最新模型相比,获得了等效性能。方法:我们提出了一种基于联合学习范式训练AI模型的隐私方法,以培训AI模型,以实现异质,分布式,数据集。该方法应用于基于梯度增强,卷积神经网络和具有长期短期记忆的复发神经网络的广泛机器学习技术。这些模型在一个心电图数据集上进行了培训,该数据集包含从六名地理分开和异质来源的43,059名患者收集的12个铅录音。研究结果:用于检测心血管异常的AI模型的结果集获得了与使用集中学习方法训练的模型相当的预测性能。解释:计算参数的方法在本地为全局模型做出了贡献,然后仅交换此类参数,而不是ML中的整个敏感数据,这有助于保留医疗数据隐私。
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如今,越来越多的人被诊断出患有心血管疾病(CVD),这是全球死亡的主要原因。鉴定这些心脏问题的金标准是通过心电图(ECG)。标准的12铅ECG广泛用于临床实践和当前的大多数研究。但是,使用较少的铅可以使ECG更加普遍,因为它可以与便携式或可穿戴设备集成。本文介绍了两种新型技术,以提高当前深度学习系统的3铅ECG分类的性能,从而与使用标准12铅ECG训练的模型相提并论。具体而言,我们提出了一种以心跳回归数量的形式的多任务学习方案,以及将患者人口统计数据整合到系统中的有效机制。随着这两个进步,我们在两个大规模的ECG数据集(即Chapman和CPSC-2018)上以F1分数为0.9796和0.8140的分类性能,这些数据分别超过了当前最新的ECG分类方法,该方法超过了当前的ECG分类方法。甚至那些接受了12条铅数据的培训。为了鼓励进一步开发,我们的源代码可在https://github.com/lhkhiem28/lightx3ecg上公开获得。
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Seizure type identification is essential for the treatment and management of epileptic patients. However, it is a difficult process known to be time consuming and labor intensive. Automated diagnosis systems, with the advancement of machine learning algorithms, have the potential to accelerate the classification process, alert patients, and support physicians in making quick and accurate decisions. In this paper, we present a novel multi-path seizure-type classification deep learning network (MP-SeizNet), consisting of a convolutional neural network (CNN) and a bidirectional long short-term memory neural network (Bi-LSTM) with an attention mechanism. The objective of this study was to classify specific types of seizures, including complex partial, simple partial, absence, tonic, and tonic-clonic seizures, using only electroencephalogram (EEG) data. The EEG data is fed to our proposed model in two different representations. The CNN was fed with wavelet-based features extracted from the EEG signals, while the Bi-LSTM was fed with raw EEG signals to let our MP-SeizNet jointly learns from different representations of seizure data for more accurate information learning. The proposed MP-SeizNet was evaluated using the largest available EEG epilepsy database, the Temple University Hospital EEG Seizure Corpus, TUSZ v1.5.2. We evaluated our proposed model across different patient data using three-fold cross-validation and across seizure data using five-fold cross-validation, achieving F1 scores of 87.6% and 98.1%, respectively.
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心血管疾病(CVD)是全球死亡的第一大原因。尽管有越来越多的证据表明心房颤动(AF)与各种CVD有着密切的关联,但这种心律不齐通常是使用心电图(ECG)诊断的,这是一种无风险,无侵入性和具有成本效益的工具。在任何威胁生命的疾病/疾病发展之前,不断和远程监视受试者的心电图信息迅速诊断和及时对AF进行预处理的潜力。最终,可以降低CVD相关的死亡率。在此手稿中,展示了体现可穿戴心电图设备,移动应用程序和后端服务器的个性化医疗系统的设计和实施。该系统不断监视用户的心电图信息,以提供个性化的健康警告/反馈。用户能够通过该系统与他们的配对健康顾问进行远程诊断,干预措施等。已经评估了实施的可穿戴ECG设备,并显示出极好的一致性(CVRMS = 5.5%),可接受的一致性(CVRMS = CVRMS = CVRMS = 12.1%),可忽略不计的RR间隙错误(<1.4%)。为了提高可穿戴设备的电池寿命,提出了使用ECG信号的准周期特征来实现压缩的有损压缩模式。与公认的架构相比,它在压缩效率和失真方面优于其他模式,并在MIT-BIH数据库中以ECG信号的某个PRD或RMSE达到了至少2倍的Cr。为了在拟议系统中实现自动化AF诊断/筛查,开发了基于重新系统的AF检测器。对于2017年Physionet CINC挑战的ECG记录,该AF探测器获得了平均测试F1 = 85.10%和最佳测试F1 = 87.31%,表现优于最先进。
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COVID-19大流行已经暴露了全球医疗服务的脆弱性,增加了开发新颖的工具来提供快速且具有成本效益的筛查和诊断的需求。临床报告表明,Covid-19感染可能导致心脏损伤,心电图(ECG)可以作为Covid-19的诊断生物标志物。这项研究旨在利用ECG信号自动检测COVID-19。我们提出了一种从ECG纸记录中提取ECG信号的新方法,然后将其送入一维卷积神经网络(1D-CNN)中,以学习和诊断疾病。为了评估数字信号的质量,标记了基于纸张的ECG图像中的R峰。之后,将从每个图像计算的RR间隔与相应数字化信号的RR间隔进行比较。 COVID-19 ECG图像数据集上的实验表明,提出的数字化方法能够正确捕获原始信号,平均绝对误差为28.11 ms。我们提出的1D-CNN模型在数字化的心电图信号上进行了训练,允许准确识别患有COVID-19和其他受试者的个体,分类精度为98.42%,95.63%和98.50%,用于分类COVID-19 vs.正常,与正常人分类, COVID-19与异常心跳和Covid-19和其他类别分别与其他阶级。此外,提出的方法还为多分类任务实现了高级的性能。我们的发现表明,经过数字化的心电图信号训练的深度学习系统可以作为诊断Covid-19的潜在工具。
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心电图(ECG)的解释给出了临床信息,并有助于评估心脏功能。存在与特定类别的arrythmia相关的不同的心电图图案。卷积神经网络实际上是ECG处理中最应用的深度学习算法之一。但是,对于深度学习模型,还有许多普遍的公共参数来调整。为卷积神经网络算法选择最佳或最佳的封面计是具有挑战性的。通常,我们最终通过不同可能的值范围手动调整模型,直到获得最佳拟合模型。使用贝叶斯优化(BO)和进化算法的自动封锁调整为港口手动配置提供了解决方案。在本文中,我们建议优化具有两个级别的经常性一维卷积神经网络模型(R-1D-CNN)。在第一级别,培训残余卷积层和一维卷积神经层以学习特定于患者特定的ECG特征,多层的Perceptron层可以学习产生每个输入的最终类载体。此级别是手动,并旨在降低搜索空间。第二级是自动的,基于所提出的基于算法的博。我们提出的优化R-1D-CNN架构是在两个公开的ECG数据集上进行评估。实验结果显示,基于算法的BO实现了99.95 \%的最佳速率,而基线模型对于MIT-BIH数据库实现99.70 \%。此外,实验表明,拟议的架构与BO微调的结构比其他拟议的架构更高的精度。与以前的作品相比,我们的建筑达到了良好的结果,并基于不同的实验。
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Cardiac resynchronization therapy (CRT) is a treatment that is used to compensate for irregularities in the heartbeat. Studies have shown that this treatment is more effective in heart patients with left bundle branch block (LBBB) arrhythmia. Therefore, identifying this arrhythmia is an important initial step in determining whether or not to use CRT. On the other hand, traditional methods for detecting LBBB on electrocardiograms (ECG) are often associated with errors. Thus, there is a need for an accurate method to diagnose this arrhythmia from ECG data. Machine learning, as a new field of study, has helped to increase human systems' performance. Deep learning, as a newer subfield of machine learning, has more power to analyze data and increase systems accuracy. This study presents a deep learning model for the detection of LBBB arrhythmia from 12-lead ECG data. This model consists of 1D dilated convolutional layers. Attention mechanism has also been used to identify important input data features and classify inputs more accurately. The proposed model is trained and validated on a database containing 10344 12-lead ECG samples using the 10-fold cross-validation method. The final results obtained by the model on the 12-lead ECG data are as follows. Accuracy: 98.80+-0.08%, specificity: 99.33+-0.11 %, F1 score: 73.97+-1.8%, and area under the receiver operating characteristics curve (AUC): 0.875+-0.0192. These results indicate that the proposed model in this study can effectively diagnose LBBB with good efficiency and, if used in medical centers, will greatly help diagnose this arrhythmia and early treatment.
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心律不齐的右心肌病(ARVC)是一种遗传性心肌疾病,在患者生命的第二和十年之间出现,导致35岁之前的心脏突然死亡的20%。在心电图(ECG)上,在降低过早心血管死亡率中可能具有至关重要的作用。在我们的分析中,我们首先概述了基于纸张的ECG信号的数字化过程,该空间过滤器旨在消除数据集图像中与ECG波形无关的黑暗区域,从而产生不良的噪声。接下来,我们建议使用低 - 复杂性卷积神经网络来检测心律失常心脏病,迄今为止尚未通过使用深度学习方法来研究,迄今为止的使用,达到高分类准确性,即99.98%的训练和98.6%测试准确性,与其他心律失常异常相反,在疾病上,其主要鉴定标准是ECG形态的无限千伏变化。最后,通过进行光谱分析,我们研究了与ARVC患者相对应的正常ECG和ECG之间频率领域的显着区别。在我们遇到统计学上显着分化的18个频率中,有16个中,正常的心电图的特征是与异常相比更大的归一化振幅。本文进行的总体研究强调了将数学方法整合到各种疾病的检查和有效诊断中的重要性,旨在为他们的成功治疗做出重大贡献。
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心血管疾病是世界各地最常见的死亡原因。为了检测和治疗心脏相关的疾病,需要连续血压(BP)监测以及许多其他参数。为此目的开发了几种侵入性和非侵入性方法。用于持续监测BP的医院中使用的大多数现有方法是侵入性的。相反,基于袖带的BP监测方法,可以预测收缩压(SBP)和舒张压(DBP),不能用于连续监测。几项研究试图从非侵​​入性可收集信号(例如光学肌谱(PPG)和心电图(ECG))预测BP,其可用于连续监测。在这项研究中,我们探讨了自动化器在PPG和ECG信号中预测BP的适用性。在12,000岁的MIMIC-II数据集中进行了调查,发现了一个非常浅的一维AutoEncoder可以提取相关功能,以预测与最先进的SBP和DBP在非常大的数据集上的性能。从模拟-II数据集的一部分的独立测试分别为SBP和DBP提供了2.333和0.713的MAE。在40个主题的外部数据集上,模型在MIMIC-II数据集上培训,分别为SBP和DBP提供2.728和1.166的MAE。对于这种情况来说,结果达到了英国高血压协会(BHS)A级并超越了目前文学的研究。
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近年来,深度学习显示了广泛区域的潜力和效率,包括计算机视觉,图像和信号处理。然而,由于缺乏算法决策和结果的解释性,用户应用程序仍然存在转化挑战。这个黑匣子问题对于高风险应用程序(例如与医疗相关的决策制定)尤其有问题。当前的研究目标是设计一个可解释的深度学习系统,用于对脑电图的时间序列分类(EEG)进行睡眠阶段评分,以此作为设计透明系统的一步。我们已经开发了一个可解释的深神经网络,该网络包括基于内核的层,该层是基于人类专家在视觉分析记录的视觉分析中用于睡眠评分的一组原理。将基于内核的卷积层定义并用作系统的第一层,并可用于用户解释。训练有素的系统及其结果从脑电图信号的微观结构(例如训练的内核)以及每个内核对检测到的阶段的效果,宏观结构(例如阶段之间的过渡)中解释了四个级别。拟议的系统表现出比先前的研究更大的性能,而解释的结果表明,该系统学习了与专家知识一致的信息。
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为了推动满足所有人需求并使医疗保健民主化的健康创新,有必要评估各种分配转变的深度学习(DL)算法的概括性能,以确保这些算法具有强大的态度。据我们所知,这项回顾性研究是第一个开发和评估从跨种族,年龄和性别的长期跳动间隔的AF事件检测的深度学习模型(DL)模型的概括性能(DL)模型的概括。新的复发DL模型(表示为ARNET2)是在2,147名患者的大型回顾性数据集中开发的,总计51,386小时连续心电图(ECG)。对来自四个中心(美国,以色列,日本和中国)的手动注释测试集评估了模型的概括,总计402名患者。该模型在以色列海法的Rambam医院Holter Clinic的1,730个Consecutives Holter记录中进一步验证了该模型。该模型的表现优于最先进的模型,并且在种族,年龄和性别之间进行了广泛的良好。女性的表现高于男性和年轻人(不到60岁),并且在种族之间显示出一些差异。解释这些变化的主要发现是心房颤动患病率更高(AFL)的群体的性能受损。我们关于跨组的ARNET2相对性能的发现可能对选择相对于感兴趣群的首选AF检查方法具有临床意义。
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